W połowie 1969 r. został skierowany do Bolesławca, gdzie otrzymał zadanie kompleksowego remontu dawnego kościoła ewangelickiego na Placu Zamkowym z przeznaczeniem na świątynię nowo tworzonej wspólnoty. Obiekt ten po 1945 r. przestał pełnić funkcje religijne. W 1966 r. władze Bolesławca przeznaczyły go na magazyn Bolesławieckiej Fabryki Fiolek i Ampułek „Polfa”, a 31 lipca 1968 r. wydział ds. wyznań Prezydium Wojewódzkiej Rady Narodowej we Wrocławiu wydał zgodę na wydzierżawienie go kościołowi rzymskokatolickiemu. W momencie przejęcia przez kurię świątynia była zniszczona w 70%. Konieczny był remont dachu wraz z wymianą więźby, wstawienie nowych okien, całościowy remont wieży, usunięcie jednej kondygnacji empor, wymiana drewnianych podpór empor na murowane, wymiana posadzek, remont elewacji, wykonanie nowych instalacji i tynków wewnątrz. Ponadto zaplanowano prace adaptujące obiekt do nowych funkcji: część empor postanowiono przebudować na sale katechetyczne, a partię południową za ścianą ołtarzową zamierzano podzielić na trzy kondygnacje i urządzić w niej plebanię, zakrystię, kancelarię parafialną, bibliotekę parafialną oraz mieszkania dla księży. Niezbędne było także nabycie całego wyposażenia i sprzętów liturgicznych. Prace, realizowane przez ekipę budowlaną kierowaną przez brata księdza Edwarda – Mieczysława Bobera, posuwały się bardzo szybko. W czerwcu 1969 r. rozpoczęto odgruzowywanie obiektu, a już w nocy z 24 na 25 grudnia tego roku w częściowo odnowionym wnętrzu odprawione została pierwsza msza św. – uroczysta pasterka. Z dniem 1 stycznia 1970 r. ks. E. Bober został mianowany rektorem nowego kościoła, a następnie uzyskał funkcję dziekana nowego dekanatu – Bolesławiec Zachód (1 maja 1971 r.) oraz godność prałata (15 października 1971 r.). Wyremontowana świątynia została konsekrowana przez ks. abp. Bolesława Kominka 18 kwietnia 1971 r., a nowa bolesławiecka parafia została erygowana 1 lipca 1972 r. Ks. E. Bober, którego ustanowiono jej proboszczem, przez kolejne lata nieustannie wyposażał kościół w niezbędne sprzęty i przedmioty liturgiczne.